平成2年の梅雨入り、梅雨明けは一部を除いてほぼ平年並みであった。梅雨期間の降水量は、九州、東北で多かったほか、平年の70%程度で、関東甲信では50%と少なかった。
一方、この期間に、九州地方、東北地方を中心にしばしば大雨があり、特に6月27日には北陸から東北南部にあった前線上を低気圧が東進したため、鳥海山(山形県遊佐町)で日降水量392mmのほか、山形、秋田、宮城の各県で日降水量100~200mmとなり、浸水などの被害があった。
6月28日から7月3日にかけて、前線が停滞した九州地方で大雨となった。特に7月2日には阿蘇乙姫(熊本県阿蘇町)で日降水量448mmを観測したほか、熊本、佐賀、長崎県で日降水量が300mmを超えた所があった。このため、土砂崩れ、浸水等により大きな被害があった。
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