７月12日夜から13日にかけて、日本海から東北南部にのびる梅雨前線の活動が活発となった。13日朝から昼頃にかけて、新潟県中越地方や福島県会津地方で非常に激しい雨が降り、日降水量は栃尾（新潟県栃尾市）で421mm、宮寄上（新潟県加茂市）で316mm、只見（福島県只見町）で325mmを観測するなど、記録的な大雨となった。
　この集中豪雨により、新潟県三条市、見附市、中之島町を流れる五十嵐川や刈谷田川では、相次いで堤防が決壊し、多数の浸水害が発生した。